我国新型肥料的产量所占的比重越来越大。而微生物肥料已成为新型肥料中年产量最大、应用面积最广的品种，微生物肥料会成为绿色农业发展的强大助力。微生物肥料还有以下几种优势。 
　　1、微生物肥料具有提高化肥利用率的作用 
　　近年来我国化肥的使用量上涨4.5倍，但我国粮食产量仅增长了82.8%，三大粮食作物氮肥、磷肥、钾肥的利用率却仅为33%、24%和42%。这说明仅靠大量增施化肥来提高作物产量是有限的，况且还会造成土壤和环境污染的问题。采用微生物肥料与化肥配合施用，既能保证增产，又减少了化肥使用量，降低成本，同时还能改善土壤及作物品质，减少污染。 
　　2、微生物肥料在绿色食品生产中的作用 
　　随着人民生活水平的不断提高，尤其是人们对生活质量提高的要求，对绿色无公害的食品需求不断提升。生产绿色食品的过程中要求不用或尽量少用或限量使用化肥或农药等化学物质的施用。微生物肥料肥料能保护和促进农作物生长和提高品质；其次不会产生和积累有害物质；三是对生态环境和土壤环境无不良影响。符合了绿色食品生产和绿色农业发展的要求。 
　　3、微生物肥料在环保中的作用 
利用微生物的特定功能分解发酵城市生活垃圾及农牧业废弃物，制成微生物肥，能将城市生活垃圾合理再利用。另外还有将微生物肥料作为土壤净化剂使用。

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